Eine indonesische Wissenschaftlerin macht 2003 eine furchtbare Entdeckung. 20 Jahre später streiten Joel und Tess über Ellies Schicksal, während sie sich durch das längst aufgegebene Bosten schlagen. Zusammenfassung der zweiten Episode "Infiziert" (OV: "Infected") von "The Last of Us"-Staffel 1 mit einem spannenden Inside-the-Episode-Video und einer Bildergalerie zur Folge.
Im September 2003 wird in Jakarta die Wissenschaftlerin Ratna Pertiwi (Christine Hakim), die für die Universität von Indonesien als Professorin für Pilzkunde arbeitet, vom Militär abgeholt und zur Basisstation gebracht. Dort untersucht sie die Leiche einer Arbeiterin, die zuvor ihre Kollegen angegriffen hatte und getötet wurde. Erschrocken stellt Ratna fest, dass die Frau von einem Pilz der Gattung Ophiocordyceps infiziert wurde, der sie in eine Art Zombie verwandelt hat. Als sie erfährt, dass einige der Arbeiter, die ebenfalls gebissen wurden, entkommen sind, ist sie geschockt. Sie erklärt dem Militär, dass es keine Medikamente oder Impfungen gegen den Pilzparasiten gebe. Das Einzige, was die Soldaten unternehmen könnten, sei die Stadt zu bombardieren, damit sich die Infektion etwas langsamer verbreitet.
Im Jahr 2023 haben Joel (Pedro Pascal), Tess (Anna Torv) und die 14-jährige Ellie (Bella Ramsey) die Nacht in einem Gebäude außerhalb der Quarantänezone von Bosten verbracht. Als Ellie aufwacht, wird sie von den beiden Erwachsenen verhört. Tess will wissen, warum das Mädchen für Marlene (Merle Dandridge) und die Rebellengruppe Fireflies so wichtig ist. Ellie verrät ihr, dass die Fireflies im Westen einen Standort mit Ärzten und Wissenschaftlern hätten. Da Ellie schon seit mehr als drei Wochen infiziert wurde, ohne dass die Krankheit ausgebrochen ist, hoffen die Rebellen, dass sie der Schlüssel sei, um ein Medikament herzustellen. Joel ist weiterhin skeptisch, doch Tess kann ihn überzeugen, dass sie das Mädchen zum vereinbarten Treffpunkt bringen.
Außerhalb des Gebäudes sieht Ellie zum ersten Mal das Ausmaß der Zerstörung der Stadt. Bosten wurde bombardiert, wie fast alle großen Städte. Nach über 20 Jahren haben die Pflanzen einen Großteil der verfallenen Stadt zurückerobert und bewuchern die zerstörten Gebäude. Die drei überlegen, welchen Weg sie am besten nehmen, um zum Treffpunkt am State-Haus zu gelangen. Sie entscheiden sich für den längeren, aber vermeintlich weniger gefährlichen Weg durch ein verfallenes Hotel. Als sie von der Terrasse die Lage überschauen, entdecken sie eine Horde Infizierter, die ihnen den weiteren Weg versperrt. Ellie erkennt, dass sie untereinander vernetzt sind. Tess erklärt ihr, dass das Pilzgeflecht auch unterirdisch wachse und die Fasern sich zum Teil über fast zwei Kilometer erstrecken. Über dieses Geflecht sind die Infizierten miteinander vernetzt und können darüber auch kommunizieren. Wenn man auf die falsche Stelle trete und das Geflecht berühre, würden dadurch sogar Schwärme von Infizierten aktiviert werden, die sich weit entfernt befinden.
Joel und Tess planen um: Sie müssen nun doch die kurze Strecke durch das heruntergekommene Museum nehmen. Die drei müssen sehr vorsichtig sein. Vor allem, als Ellie im Museum einen getöteten Mann entdeckt, dessen Wunden noch nicht sehr alt sind. Ellie ist erschrocken, wie brutal die Pilzinfizierten den Fremden zugerichtet haben. Als sie selbst gebissen wurde, waren die Verletzungen nicht so schlimm.
So leise wie möglich schleichen sie das Treppenhaus hinauf. Doch plötzlich bricht die Decke hinter ihnen ein. Die drei retten sich in einen Raum, doch zwei Infizierte sind durch den Lärm auf sie aufmerksam geworden. Ihre Körper haben sich bereits sehr verwandelt: Ihre Köpfe sehen aus wie große, bunte Pilzgebilde, aus deren deformierten Mündern gierig die Fasern sprießen, um nach neuen Wirten zu suchen. Sie befinden sich bereits im dritten Verwandlungsstadium und werden Clicker genannt. Joel erklärt Ellie, dass die Infizierten in diesem Stadium nicht sehen, sondern nur hören können. Sie müssen sich daher so still wie möglich verhalten. Allerdings kommt es dennoch zu einem Angriff und Joel und Tess unternehmen alles, um Ellie zu schützen. Nachdem die Clicker mit Waffengewalt außer Gefecht gesetzt wurden, muss die 14-Jährige allerdings feststellen, dass sie erneut gebissen wurde. Joel hat Sorge, dass sie dieses Mal nicht dagegen immun ist, doch Tess glaubt an Ellies Bestimmung.
Sie gelangen schließlich zum vereinbarten Treffpunkt. Im Gebäude entdecken sie zu ihrem Entsetzen die Leichen der Fireflies. Sie können erkennen, dass anscheinend jemand von ihnen infiziert wurde und sich die gesunden und kranken Menschen gegenseitig bekämpft haben. Am Ende verloren alle ihr Leben. Tess ist aufgebracht und versucht herauszufinden, wo die Fireflies mit Ellie hinfahren wollten. Joel hat jedoch resigniert. Für ihn ist die Mission beendet, und er will zurück in die Quarantänezone. Tess entgegnet allerdings, dass sie bleiben werde. Sie gesteht, dass sie beim Angriff im Museum ebenfalls gebissen wurde. Sie zeigt Joel ihre Wunde an der Schulter, die Infektion ist bereits vorangeschritten. Ellies Wunde ist hingegen gleichgeblieben. Tess kann Joel überzeugen, dass Ellie tatsächlich immun ist und damit der Schlüssel zu einem Heilmittel sein kann. Sie bittet ihn, die Teenagerin zu ihren Verbündeten Bill und Frank zu bringen, diese würden dann alles Weitere organisieren.
Plötzlich bemerken sie, dass die toten Rebellen auf einem Pilzgeflecht liegen. Die Pilzfasern leiten die neue Information in Sekundenschnelle an sämtliche Infizierte im gesamten Umkreis weiter. Ein riesiger Schwarm macht sich auf den Weg zu den zu Joel, Tess und Ellie. Tess zögert nicht lange und wirft mehrere Fässer mit Benzin um, sodass sich die Flüssigkeit auf dem Boden verteilt. Außerdem legt sie mehrere Handgranaten dazu. Anschließend bittet sie Joel, mit Ellie zu fliehen. Sie werde sicherstellen, dass die Infizierten ihnen nicht folgen. Joel nimmt daraufhin den Arm des Mädchens und rennt mit ihr weg. Tess ist nun allein und das Gebäude wird von den Infizierten eingekesselt. Sie versucht ihr Feuerzeug zu entzünden, doch es gelingt ihr nicht. Ein Infizierter kommt auf sie zu. Er öffnet seinen Mund und Pilzfasern sprießen empor, direkt in den Mund von Tess. Ruhig empfängt sie diese wie eine Art Kuss. Dann entzündet sich endlich ihr Feuerzeug und sie wirft es auf den Boden. Aus der Ferne beobachten Joel und Ellie, wie das Gebäude explodiert.