2003: Ein mutierter Pilz verwüstet das Land. 20 Jahre später kämpft Joel unter einem totalitären Regime ums Überleben. Die aufständischen Fireflies beherbergen ein Mädchen mit einer besonderen Gabe. Zusammenfassung der ersten Episode "Wenn du in der Dunkelheit verloren bist" (OV: "When You're Lost in the Darkness") von "The Last of Us"-Staffel 1 mit einem spannenden Inside-the-Episode-Video und einer Bildergalerie zur Folge.
Im Jahr 1968 warnt Epidemiologe Dr. Neuman (John Hannah) in einer Talkshow die Zuschauer, dass es eines Tages zu einer Pilz-Pandemie kommen könnte, die die Menschen in große Gefahr bringen würde. Dies könnte geschehen, wenn sich das Klima nur etwas erwärmen würde. Der Pilz könnte dann auch menschliche Körper befallen und seinen Wirt von innen heraus auffressen. Zudem sei es dem Pilz möglich, den Körper des Wirts zu kontrollieren, damit er sich weiterverbreiten kann. Dadurch würden die infizierten Menschen zu einer Art "Pilz-Zombies" mutieren. Diese Bedrohung, könnte die gesamte Menschheit ausrotten.
35 Jahre später, im Jahr 2003, ist es schließlich so weit und die dystopische Theorie des Epidemiologen wird Realität. Ein mutierter Pilz verbreitet sich rasend schnell über den Globus und infiziert die Menschen. Überall auf der Welt bricht Chaos aus. Mittendrin in diesem Chaos befinden sich der alleinerziehende Vater Joel Miller (Pedro Pascal) und seine 14-jährige Tochter Sarah (Nico Parker) sowie Joels Bruder Tommy (Gabriel Luna). Die drei wollen aus der mit Pilz-Zombies verseuchten Stadt fliehen. Polizei und Militär versuchen vergeblich, die Lage unter Kontrolle zu bringen. Als Joel und Sarah auf einen Soldaten treffen, bekommt dieser die Anweisung von seinen Vorgesetzten, keine potenziellen Infizierten am Leben zu lassen. Er schießt auf die beiden. Bevor der Soldat erneut die Waffe auf Joel richten kann, wird er von Tommy hinterrücks erschossen. Joel hat den Angriff überlebt, Sarah wurde allerdings bei dem ersten Schusswechsel getroffen und stirbt in den Armen ihres Vaters.
Es folgt ein Zeitsprung von zwanzig Jahren. 2023 hat die Pilz-Pandemie die Welt in Schutt und Asche gelegt. Die Bedrohung ist weiterhin gegenwärtig, sodass die Städte mit den restlichen Überlebenden strikt von der Außenwelt abgeschottet werden. Die Kontrolle über die Städte und die Menschen hat ein totalitäres Regime übernommen. Die antagonistische Hintergrundfraktion FEDRA (Federal Disaster Response Agency) kontrolliert und unterdrückt die Menschen. Jeglicher Widerstand gegen das Regime wird mit dem Tod bestraft.
In dieser Militärdiktatur lebt Joel in Bosten. Er hält sich mit allerlei Jobs, für die er mit verschiedenen Lebensmittelmarken und Karten bezahlt wird, über Wasser. Zudem dealt er mit Schmuggelware wie unter anderem mit Medikamenten. Auch FEDRA-Soldat Lee (Max Montesi) gehört zu seinen Stammkunden. Durch ihn will Joel an einen alten Truck gelangen. Lee sichert ihm zu, dass der Deal steht. Im Wagen fehlt allerdings noch eine Batterie. Die hatte Joel bereits organisiert, doch seine Gefährtin Tess (Anna Torv) wurde bei dem Geschäft übers Ohr gehauen und die Batterie gestohlen. Joel benötigt die Batterie und das Auto dringend, um nach seinem Bruder zu suchen. Tommy befindet sich außerhalb der Quarantänezone und hat sich seit drei Wochen nichts mehr gemeldet. Zusammen mit Tess will Joel fliehen, um zu einem Funkturm in Wyoming zu gelangen. Dort erhofft er sich, Tommy zu finden.
In der Stadt herrscht seit einiger Zeit zudem Unruhe durch die Aufstände und Anschläge der Widerstandsgruppe "Fireflies", die sich gegen das Regime auflehnt. Auf den Hauswänden sprühen sie ihr Logo sowie ihren Slogan "Wenn du in der Dunkelheit verloren bist, suche nach dem Licht". Die Rebellengruppe hält in einem ihrer Verstecke ein junges Mädchen gefangen. Sie überwachen die 14-jährige Ellie (Bella Ramsey), um zu sehen, ob bei ihr nach einer Verletzung die Pilzinfektion ausbricht. Doch das Mädchen bleibt gesund. Rebellenanführerin Marlene (Merle Dandridge) verrät Ellie, dass sie sie als Baby bei der FEDRA-Militärschule abgegeben hat. Sie ist nicht ihre Mutter oder mit ihr verwandt, doch für Marlene spielt Ellie eine bedeutende Rolle. Sie glaubt, dass die 14-Jährige eine wichtige Bestimmung habe. Sie plant, mit den Fireflies aus Bosten die Quarantänezone zu verlassen, um das Mädchen nach Westen zu bringen.
Als Joel und Tess nach der verlorenen Batterie und dem Betrüger Robert (Brendan Fletcher) suchen, treffen sie in einem verfallenen Haus auf Marlene und Ellie. Robert hatte die Rebellen angegriffen, nachdem er auch sie wegen der Autobatterie betrogen hatte. Viele der Rebellen wurden getötet und Marlene ist verletzt. Weil sie in diesem Zustand ihre Mission nicht durchführen kann, bittet sie Joel darum, Ellie aus der Quarantänezone zu schmuggeln und zum State-Haus zu bringen. Dort würden weitere Fireflies-Mitglieder das Mädchen übernehmen und Joel alles geben, was er benötigt. Tess und Joel willigen schließlich ein. Sie bringen Ellie in ihre Wohnung, um dort die Zeit bis zum Abend zu warten. Das Mädchen findet heraus, dass Joel über sein Funkgerät Schmugglercodes empfängt: Wenn Lieder aus den 60er Jahren gespielt werden, bedeutet dies, dass es nichts Neues gibt. Lieder aus den 70er Jahren bedeuten, dass es etwas Neues gibt und Lieder aus den 80er Jahren bedeuten Ärger.
In der Dunkelheit schleichen sich die drei vor die Mauern der Stadt. In der Pufferzone des Quarantänegebiets sind viele Soldaten unterwegs auf Kontrollgängen. Sie werden von Soldat Lee entdeckt. Er zwingt sie auf die Knie und testet mit einem Gerät, ob sie infiziert sind. Tess und Joel sind gesund. Als Lee das Mädchen testet, rammt sie ihm ein Messer ins Bein. Wütend richtet Lee seine Waffe auf Ellie. In dem Moment fühlt sich Joel in die Nacht zurückversetzt, als ein Soldat seine Tochter erschoss. Joel rastet daraufhin aus und schlägt auf Lee so lange ein, bis dieser regungslos liegen bleibt. Tess findet derweil das Gerät des Soldaten. Es zeigt an, dass Ellie infiziert ist. Verzweifelt erklärt die 14-Jährige ihnen, dass sie nicht krank sei. Sie zeigt ihnen ihre Wunde, an der sie von einem Pilz befallen wurde. Die Infektion ist aber seit drei Wochen nicht weiter vorangeschritten. Niemand würde dies so lange überleben. Ellie scheint gegen die Pilzinfektion immun zu sein. Da die FEDRA im Anmarsch ist, bleibt ihnen keine Zeit zum Diskutieren. Joel schnappt sich Lees Waffe und gemeinsam mit Tess und Ellie verlässt er die Quarantänezone. Derweil ertönt aus dem Funkgerät in seiner Wohnung der 80er-Jahre "Depeche Mode"-Song "Never Let Me Down Again".